Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPGDP15428 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms