Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms