Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms