Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA4P13612 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms