Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG2P13521 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG2P13521 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCG2P13521 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG2P13521 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms