Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms