Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD2P0DJD1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms