Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC172P0C7W6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms