Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIL1P09327 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VIL1P09327 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VIL1P09327 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIL1P09327 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIL1P09327 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIL1P09327 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms