Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3P05106 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms