Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN1P04843 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN1P04843 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN1P04843 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN1P04843 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN1P04843 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN1P04843 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN1P04843 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN1P04843 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN1P04843 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN1P04843 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN1P04843 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPN1P04843 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPN1P04843 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPN1P04843 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPN1P04843 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPN1P04843 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN1P04843 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms