Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VTNP04004 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VTNP04004 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VTNP04004 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VTNP04004 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VTNP04004 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VTNP04004 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VTNP04004 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VTNP04004 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VTNP04004 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VTNP04004 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VTNP04004 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTNP04004 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTNP04004 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTNP04004 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTNP04004 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTNP04004 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VTNP04004 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VTNP04004 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VTNP04004 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms