Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
F2P00734 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F2P00734 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F2P00734 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F2P00734 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F2P00734 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F2P00734 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F2P00734 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2P00734 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F2P00734 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F2P00734 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
F2P00734 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
F2P00734 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
F2P00734 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
F2P00734 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F2P00734 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms