Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP4K4O95819 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP4K4O95819 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms