Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR1AO95602 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR1AO95602 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms