Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SURF6O75683 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SURF6O75683 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SURF6O75683 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF6O75683 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF6O75683 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF6O75683 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF6O75683 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF6O75683 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF6O75683 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF6O75683 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF6O75683 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF6O75683 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms