Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F6O75461 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F6O75461 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F6O75461 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F6O75461 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms