Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSO75390 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSO75390 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSO75390 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSO75390 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSO75390 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms