Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms