Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms