Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE8AO60658 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE8AO60658 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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