Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPLO60437 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPLO60437 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPLO60437 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPLO60437 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPLO60437 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPLO60437 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPLO60437 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPLO60437 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPLO60437 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPLO60437 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPLO60437 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms