Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN3BO60391 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms