Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP9BO43861 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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