Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms