Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNJ1O43426 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SYNJ1O43426 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ1O43426 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms