Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCP110O43303 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCP110O43303 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCP110O43303 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCP110O43303 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCP110O43303 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCP110O43303 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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