Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEFVO15553 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEFVO15553 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEFVO15553 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MEFVO15553 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MEFVO15553 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms