Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC4O15439 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC4O15439 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC4O15439 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC4O15439 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms