Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2DO15399 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms