Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF5O00463 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms