Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLRMTO00411 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLRMTO00411 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLRMTO00411 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLRMTO00411 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLRMTO00411 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLRMTO00411 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLRMTO00411 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLRMTO00411 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLRMTO00411 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLRMTO00411 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms