Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP1O00294 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP1O00294 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP1O00294 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP1O00294 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP1O00294 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP1O00294 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP1O00294 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP1O00294 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP1O00294 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP1O00294 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP1O00294 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP1O00294 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP1O00294 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TULP1O00294 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TULP1O00294 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP1O00294 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms