Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN34H7C241 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms