Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms