Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DXG7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DXG7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DXG7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DXG7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms