Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STRCP1A6NGW2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCP1A6NGW2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms