Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEMP2A6NFY4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms