Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS37CA5D8V6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms