Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARFGEF2Q9Y6D5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARFGEF2Q9Y6D5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARFGEF2Q9Y6D5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARFGEF2Q9Y6D5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.7 ms