Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD54BQ9Y620 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAD54BQ9Y620 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD54BQ9Y620 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD54BQ9Y620 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms