Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C1

NOP16, Nucleolar protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP16Q9Y3C1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NOP16Q9Y3C1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOP16Q9Y3C1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP16Q9Y3C1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP16Q9Y3C1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP16Q9Y3C1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms