Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRELID3BQ9Y3B1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRELID3BQ9Y3B1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms