Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HECTD1Q9ULT8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HECTD1Q9ULT8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECTD1Q9ULT8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECTD1Q9ULT8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECTD1Q9ULT8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD1Q9ULT8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD1Q9ULT8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECTD1Q9ULT8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECTD1Q9ULT8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HECTD1Q9ULT8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECTD1Q9ULT8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECTD1Q9ULT8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HECTD1Q9ULT8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD1Q9ULT8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms