Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTEL1Q9NZ71 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RTEL1Q9NZ71 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTEL1Q9NZ71 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RTEL1Q9NZ71 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTEL1Q9NZ71 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTEL1Q9NZ71 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTEL1Q9NZ71 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms