Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAJC28Q9NX36 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC28Q9NX36 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAJC28Q9NX36 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJC28Q9NX36 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms