Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR3EQ9NVU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR3EQ9NVU0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR3EQ9NVU0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR3EQ9NVU0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLR3EQ9NVU0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR3EQ9NVU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms