Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CD248Q9HCU0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD248Q9HCU0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD248Q9HCU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CD248Q9HCU0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD248Q9HCU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms