Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP4F12Q9HCS2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYP4F12Q9HCS2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP4F12Q9HCS2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP4F12Q9HCS2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP4F12Q9HCS2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms