Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDGFDQ9GZP0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDGFDQ9GZP0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDGFDQ9GZP0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDGFDQ9GZP0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PDGFDQ9GZP0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDGFDQ9GZP0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PDGFDQ9GZP0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PDGFDQ9GZP0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDGFDQ9GZP0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDGFDQ9GZP0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PDGFDQ9GZP0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDGFDQ9GZP0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDGFDQ9GZP0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDGFDQ9GZP0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDGFDQ9GZP0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms